2009年，马士基(MAERSK)船公司“阿拉巴马”号船遭遇索马里海盗劫持，其船长理查德·菲利普斯(Richard Phillips)主动把自己交给海盗为人质以换取其他船员的安全。在菲利普斯船长被索马里海盗劫持了四天之后，英勇的美国海豹突击队狙击手果断击毙三名海盗，菲利普斯船长安全获救，并成为美国英雄。

失去了心爱的女人，波恩（马特.戴蒙 饰）面临更为艰难的日子，他努力回忆，却只能在睡梦中被脑海里一知半解的闪回所惊醒，依然无法记起自己的身份　　但是波恩注定不是平凡人，不等他冷静下来好好“寻找回”自己真正的身份，中情局派出的杀手又接踵而至。在接连的几次较量之后，杰森.伯恩终于被彻底激怒，决定反戈一击——他主动追击杀手，到过莫斯科、马德里。巴黎，也在伦敦和丹吉尔做过停留。　　随着问题一个一个解决，杰森回到了纽约，在那里，他将会找到一切的答案，寻回自己的身份。

经过上一集的腥风血雨之后，伯恩（马特·达蒙 饰）和女朋友玛丽（弗兰卡·泼坦特 饰）隐居在印度偏僻的海边小镇，想忘记以前的生活。一天，神秘组织的杀手来到小镇，打破了伯恩二人世界的宁静，女友玛丽在逃亡途中

《谍影重重5》将探索后斯诺登时代，马特·达蒙饰演的伯恩将重出江湖，对抗文森·卡索饰演的反派。